Министерство здравоохранения Республики Южная Осетия является органом исполнительной власти Республики Южная Осетия, осуществляющим функции по выработке государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере охраны здоровья граждан на территории Республики Южная Осетия, лицензирования фармацевтической и медицинской деятельности, включая вопросы организации медицинской профилактики, в том числе инфекционных заболеваний, медицинской помощи и медицинской реабилитации, фармацевтической деятельности, качества, эффективности и безопасности лекарственных средств, судебно-медицинских экспертиз и судебно-психиатрических экспертиз, предоставления государственных услуг в сфере охраны здоровья, а также по контролю и надзору в сфере здравоохранения.